氨基酸系列
Nature子刊:黄硕团队首次通过纳米孔实现20种
发布时间:2024-04-20 22:07:09 来源:18新利luck官网 作者:18新利体育luck官网

  该研究构建了一种工程化耻垢分枝杆菌膜蛋白A(MspA)纳米孔,实现了全部蛋白质氨基酸及它们的翻译后修饰检测。

  蛋白质是生命活动的执行者,由20种天然存在的蛋白质氨基酸构成。与高歌猛进的DNA测序技术相比,高灵敏、高通量的蛋白质测序技术的发展严重滞后,目前仅Edman降解法和质谱法能做到蛋白质测序。然而,Edman降解法的序列分析长度有限,质谱法的检测限和动态范围阻碍了低丰度蛋白质的分析鉴定和新型生物标志物的发现。

  单分子蛋白质测序技术可以提供更高的灵敏度和准确度,有望助力单细胞蛋白质组学的发展。2023年,Nature 杂志将单分子蛋白质测序技术评为未来一年对科技创新产生巨大影响的七项新技术之一。

  相比于核酸的4种核苷酸基本单元,蛋白质由20种氨基酸组成,具有更复杂的化学多样性。无论采取哪种读出方式,检测20个可区分的信号本身就是一个很大的挑战,准确解读蛋白质上的翻译后修饰信息对分析方法的检测分辨率提出了更高的要求。

  该研究构建了一种工程化耻垢分枝杆菌膜蛋白A(MspA)纳米孔,实现了全部蛋白质氨基酸及它们的翻译后修饰检测。该工作在孔道的收缩区域引入了一个镍离子-次氮基三乙酸(Ni-NTA)适配体,利用配位相互作用实现了全部蛋白质氨基酸的直接检测和区分,区分准确率高达98.8%,这是世界上第一个能完全分辨所有20种蛋白质氨基酸的纳米孔。在这项研究中,他们还采用了同种孔道,进而同时区分了4种常见的翻译后修饰氨基酸。

  学化学化工学院博士生王可凡、张善雨,学物理学院博士生周骁为该论文共同第一作者,黄硕教授为论文通讯作者。


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